在國內(nèi)，市場普遍認(rèn)為，如果是公司制企業(yè)，就必須繳稅；如果是合伙制企業(yè)，就無須繳稅。其實，這是對合伙企業(yè)稅收制度的根本誤解，正是這一誤解又派生出其他種種誤解。從公平稅負和防止偷逃稅角度考慮，絕大多數(shù)國家都是根據(jù)合伙企業(yè)的實際特點，而相應(yīng)采取以下三種不同的合伙企業(yè)稅制模式：

（1）不將合伙企業(yè)作為納稅主體的非實體納稅模式，主要流行于合伙企業(yè)尚未演進為獨立實體的國家；

（2）將合伙企業(yè)作為獨立納稅主體看待的實體納稅模式，主要流行于合伙企業(yè)已經(jīng)演進為獨立實體的國家；

（3）介于實體模式與非實體模式之間的準(zhǔn)實體納稅模式，該模式雖然不將合伙企業(yè)作為納稅主體，但是需要在合伙企業(yè)環(huán)節(jié)作統(tǒng)一的收入和成本核算，對核算出的應(yīng)納稅所得，必須由合伙人為之分別繳稅。

我國在1997年頒布的《合伙企業(yè)法》中，就明確合伙企業(yè)不再是單純的“伙伴關(guān)系”，而是擁有了相對獨立的財產(chǎn)權(quán)的準(zhǔn)法人實體。因此，財稅【2000】91號（以下簡稱91號）文即要求對合伙企業(yè)采取準(zhǔn)實體納稅模式。其明確規(guī)定：合伙企業(yè)以每一個合伙人為納稅義務(wù)人；大連公司注冊合伙企業(yè)應(yīng)當(dāng)將每一納稅年度的收入總額，減除成本、費用以及損失后的余額，作為投資者個人的生產(chǎn)經(jīng)營所得；生產(chǎn)經(jīng)營所得包括企業(yè)分配給投資者個人的所得和企業(yè)當(dāng)年留存的所得（利潤）。這樣，即使是合伙企業(yè)將利潤留成下來不分配，合伙人也應(yīng)當(dāng)繳稅，以避免合伙企業(yè)本身成為避稅工具。

2006年《合伙企業(yè)法》修訂后，合伙企業(yè)可以采取有限合伙這種更多借鑒公司的新型合伙形式。對有限合伙這種具備了公司“有限責(zé)任”機制的新型合伙企業(yè)，有理由和可能對其采取實體納稅模式，即將其直接作為納稅主體對待。但財稅【2008】159號（以下簡稱159號）制定時，一方面繼續(xù)對其采取準(zhǔn)實體納稅模式，不將其作為納稅主體對待；另一方面為防范其成為避稅工具，對其重申了必須作為“應(yīng)納稅所得核算主體”的一系列要求。159號文明確：合伙企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得采取“先分后稅”的原則，具體應(yīng)納稅所得額的計算按照91號文的有關(guān)規(guī)定執(zhí)行，且所稱“生產(chǎn)經(jīng)營所得和其他所得”既包括合伙企業(yè)分配給所有合伙人的所得，還包括企業(yè)當(dāng)年留存的所得（利潤）。同時還明確：合伙人是法人和其他組織的，在計算其繳納企業(yè)所得稅時，不得用合伙企業(yè)的虧損抵減其盈利。